北京同仁医院拥有教育部重点实验室1个，工信部重点实验室1个，北京市重点实验室5个;工程研究中心1个，省部级工程研究中心4个;省部级国家科技合作基地2个，北京实验室1个。医院是全国防盲技术指导组和防聋治聋技术指导组组长单位，设有世界卫生组织防盲合作中心和世界卫生组织防聋合作中心，作为国际眼库协会会员单位，设有北京同仁眼库。
北京同仁医院拥有中国工程院院士1名，国家万人计划4人，长江学者1名，百千万工程人选9人，国家杰出青年基金获得者2名，国家青年基金获得者1名，享受政府特殊津贴专家11名，荣获省部级突出贡献专家15人，北京学者4名，青年北京学者2名，万人计划教学名师1人。
北京同仁医院眼底科引领国内眼底病治 疗的发展方向，在国内率先开展了间接检眼镜下孔源性视网膜脱离的手术治 疗，蕞早开展了玻璃体视网膜显微手术，创新了视网膜中央动脉栓塞的玻璃体手术治 疗，在驱逐性出血以及眼底肿瘤的放射性敷贴治 疗和局部切除手术治 疗等多个方面处于国内和国际前沿。
北京同仁医院眼底科坚持以临床服务为根本，以科研创新为导向，医疗、教学、科研、预防发展的目标，推动了创新型的科学研究工作的持续开展和学科临床服务水平的不断提高。