现任浙江中医药大学教授，主任医师，博士生导师，中华中医药学会方剂分会主任委员，全国中医文献学研究会常务理事，全国政协委员，中国民主促进会浙江省委员会副主任委员。长期从事方剂学的教学工作，治学严谨，1996年被授予“浙江省教师”称号。长期坚持临床，医术精湛，2001年被授予“浙江省名中医”称号。2002年被国家人事部、卫生部、国家中医药管理局确定为“全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师”。编著出版了《历代名方精编》、《金匮方百家医案评议》、《古今奇效单方评议》、《金匮要略校注》、《中医必读》、《连建伟中医传薪录》等著作。并先后担任国家规划教材《方剂学》编委、副主编，主编,协编教材中药专业《方剂学》副主编，共发表专业论文80余篇。《金匮要略校注》获国家中医药管理局1992年度中医药科技进步二等奖。精于脉理，平脉辨证，擅长运用经方及后世各家医方，数方相合，化裁得宜，尤对内科脾胃病有丰富的经验。
连老认为，脾喜燥恶湿，易为湿困，故脾病须细察有无兼湿，然后权衡虚实，孰为主次而兼治之。如湿邪重浊困脾者，首要调畅气机，正如《温病条辨》所云：“气化则湿亦化。”如三仁汤、平胃散、胃苓汤、藿香正气散等随证加减，意在通过芳化、苦燥、淡渗等法祛湿醒脾，复其灵动之性。至于脾气虚弱而生湿者，老师善用温阳法。脾气虚者，临床用四君子汤加减；兼气滞，则加陈皮补气行滞化湿；若兼痰浊，则加制半夏以燥湿化痰。脾气湿者，选用参苓白术散、资生丸健脾、渗湿止泻。如脾阳不足，寒湿内生，症见脘腹冷痛、下利清谷、肢体肿胀等，则善用理中丸或附子理中汤以治之。
久病痼疾，络伤入血，化瘀
脾胃病多为饮食劳倦，或情志内伤，肝失疏泄，以致中焦气机阻滞，日久影响血络通畅，而致络脉瘀阻。亦有疾病迁延日久，气血津液亏虚，无以荣养血脉，络脉涩滞而致瘀血内停，或阴虚燥热，耗伤阴血，又灼伤血络，血溢于外，留而成瘀。是故《临证指南医案》云，“初病在气，久必入血”，“胃痛久而屡发，必有凝痰聚瘀”。
气滞与瘀血互为因果，互为影响。气滞日久，必有血瘀，瘀血留而不化，则气滞更甚，导致病势缠绵，难以根治。连老慢性胃病时，尤为注重化瘀。因气滞而血瘀者，往往在药中酌加化瘀之药，常用枳壳、佛手、丹参、郁金、红花、桃仁、川芎等，以促进气血运行，消散胃络瘀血，使营血流畅，瘀消络通。因气虚而血瘀者，常用补中汤健脾，升降气机，佐以丹参、白檀香、降香、延胡索等兼调气血，达到气旺则血行，血行则瘀散。连老善用丹参，取其破宿瘀而生新血，功同四物，既可又可养血。如用丹参饮，可除心胃诸痛。对于胃火亢盛灼伤血络致瘀血者，可用丹皮、丹参、赤芍等凉血、、散瘀；对于阴虚津伤之证，可用北沙参、麦门冬、当归、丹参、三七、白及等以养阴和血、消肿生肌。现代医学表明，化瘀药不但有止痛作用，还可改善胃黏膜的血液循环，消除炎症细胞浸润，促进病灶恢复，防止组织异型增生。