医院拥有教育部儿科学国家重点学科和教学团队，是首都医科大学儿科医学院和儿科学系所在地，现有教授、副教授84人，博、硕士研究生导师64人，承担着博士、硕士研究生、七年制儿科专业、护理大中专及继续医学教育等多层次教学任务，并设有博士后流动站，每年为社会输送大量儿科人才。
北京儿童医院积极发挥学科作用，领航儿科行业发展。2013年牵头组建北京儿童医院集团，创新“病人不动、医生移动”的模式服务全国患儿，目前集团成员已达15家。医院不仅在国内享有很高的声誉，而且在国际儿科界也有广泛影响，与美国、俄罗斯、加拿大、意大利、澳大利亚、瑞典、德国、法国、日本、新加坡和捷克等国的儿童医疗机构建立了良好的关系和广泛的合作。
经过多年的经验积累，各种小儿泌尿生殖系疾病的诊断和达到国内、国际先进水平。其中泌尿生殖系畸形中尿道下裂个体化积累上万例经验，一期手术修复成功率达80%以上，且外形美观;先天性肾积水肾盂输尿管吻合手术成功率95%以上。泌尿生殖系肿瘤中各种肾脏肿瘤病理类型的诊治积累了丰富的临床经验，其中肾母细胞瘤经手术、化疗及放疗等一系列综合长期生存率90%以上;横纹肌肉瘤及睾丸肿瘤也取得满意效果。泌尿生殖系创伤中外伤性后尿道断裂急症经会阴入路一期手术修复后尿道，明显缩短病程、减少并发症，陈旧性外伤性后尿道狭窄与闭锁经会阴修复或会阴联合耻骨入路修复积累了丰富经验，肾脏外伤特别是肾盂输尿管交接部断裂的诊治达国际水平。神经性膀胱功能障碍：根据尿流动力学改变选择适当，清洁间歇导尿和可控性尿流改道在保护患儿肾功能前提下获得排尿控制、提高生活质量。熟练应用腹腔镜微创手术：用于肾盂输尿管连接部梗阻、气膀胱手术、重复肾半肾切除、触摸不到的隐睾、精索静脉曲张、肾切除、前列腺囊切除等，使损伤减小、病程缩短、早期恢复正常活动。
北京作为中国的首都，拥有众多医疗机构和专家，每天吸引着大量的患者前来就诊。然而，由于工作、学习或其他原因，很多人都面临无法亲自陪伴家人或朋友就医的困扰。在这个候，北京医院陪诊-北京跑腿服务就成为了大家的好帮手。