在采购、工程等项目上体现的比较多。一般的工程项目，甲方为了保障自己的权益，都会要去中标的公司，在签订合同以后，先交一部分保证金到甲方账户，以后一旦发生纠纷，自己的损失会少一点。但是对于一个公司来说，流动资金会关系到公司项目的进度，一般不愿意把大额的钱给到甲方，这个时候就可以通过保函的形式，用保函替代现金交给甲方。保函的出现对于双方其实是一个双赢的事情，甲方利益有保障，乙方也有足够的流动资金运作公司，所以现在很多需要保证金的项目都愿意开具保函，这不限制于工程项目，也包括了采购、招标等等。
关于保函保证金的概念是什么?
保函保证金是指针对银行保证函所支付的保证金。
保函(Letter of Guarantee, L/G)又称保证书，是指银行、保险公司、担保公司或个人应申请人的请求，向第三方开立的一种书面信用担保凭证。保证在申请人未能按双方协议履行起责任或义务时，由担保人代其履行一定金额、一定期限范围内的某种支付责任或经济赔偿责任。 保函即为保证书，为了方便，一般公司及银行都印有一定格式的保证书。其作用包括凭保函交付货物、凭保函签发清洁提单、凭保函倒签预借提单等。
保函手续费
境内非融资性保函手续费收取标准：
1、支付保函手续费：
银行为客户开立支付保函业务时，需要向客户征收每季千分之五的保函手续费，指导价为千分之一每季，是500元每季。
2、履约保函手续费：
银行为客户开立履约保函业务时，需要像客户征收每季0.5%的保函手续费，指导价为0.1%，每季度收取500元。
3、投标保函手续费：
银行为客户开立投标保函业务时，需要像客户征收每季0.5%的保函手续费，指导价为0.05%，每季度收取500元。
4、分期付款与延期付款保函手续费：
银行为客户开立分期付款、延期付款保函业务时，均需要像客户征收每季0.5%的保函手续费，指导价为0.15%，每季度收取500元。
5、关税保函手续费：
银行为客户开立关税保函业务时，需要向客户征收每季0.5%的保函手续费，指导价为0.15%，每季度收取500元。
6、租赁保函手续费：
银行为客户开立租赁保函业务时，需要像客户征收每季0.5%的保函手续费，指导价为0.15%，每季度收取1000元。
7、其他保函手续费：
预付款保函、工程质量保函与保释金保函手续费分别为：指导价0.1%、0.1%、0.15%，上限都是0.5%，收费分别是500、500、1000元/季。
保函手续费分非常多种类，其中就有分六大类的，还有零零散散的归于其他类中。就比如有关税保函手续费，还有租赁保函手续费，投标保函手续费，公正质量保函等等等等，非常的多，并且根据保函的种类不同，首付的手续费也是不一样的，而且有些还根据季度收费等等。
履约保函不可代替质保金，但是履约保函可以开到质保期结束后，但是这个保函，有履约+质保的成分在里边，一般来说，是两个保函，只不过开到了一起，但是相对来说，这种保函比较难开，而且履约保证金的比例和质保金的比例是不一样的，所以如果开到一起，有时候不划算，而且质量期一般都长于施工或者供货期。
在实际案例中，都不需要保函来替代保证金，所以会造成，从项目开始投标，交投标保证金开始，这笔费用会随着中标，合同履行，一直在不断的增长，比如投标保证金一般都很低，几万块，中标后，履约保证金一般是合同金额的10%左右，质量保函一般是5%-15%左右，所以这笔钱基本从投保结束后一直增长，还不会退，一直到了质保结束后，这笔钱才有可能退，所以保函才起到了很大的作用。