把保函与跟单信用证相比，当事人的权利和义务基本相同，所不同的是跟单信用证要求受益人提交的单据是包括运输单据在内的商业单据，而保函要求的单据实际上是受益人出具的关于委托人违约的声明或证明。这一区别，使两者适用范围有了很大的不同，保函可适用于各种经济交易中，为契约的一方向另一方提供担保。另外，如果委托人没有违约，保函的担保人就不必为承担赔偿责任而付款。而信用证的开证行则必须先行付款。
履约保函：是由担保人为施工方(申请人)向业主(受益人)提供的，保证施工方履行工程建设合同规定的相关责任和义务的保函。如果承包商不履行合同，业主可要求保证人在保函金额内承担保证责任。保证人在承担保证责任后，可依法向承包商追偿。担保公司提供的履约保函一般为有条件的保函，即在业主提出索赔时必须提供承包商违约的证明，保证人核实后才承担保证责任。履约保证担保也可以适用于分包合同、材料设备供货合同的履行。
质量保函：是保证人为申请人在保修期内按合同的约定履行保修义务，而向受益人提供的书面担保。若非受益人或不可抗力的原因，申请人没有按照合同的约定履行保修义务的，受益人有权要求保证人代为履行合同义务或赔偿损失。
根据银行保函的性质不同，可分为从属性保函和见索即付保函两种。
见索即付保函是指对由银行出具的，书面形式表示在受益人交来符合保函条款的索赔书或保函中规定的其它条件时，承担无条件的付款责任的银行保函。
从属性保函是担保人在保函中对受益人的索赔及对该索赔的受理设置了若干条件的限制，保留有一定的抗辩权利，只有在一定的条件得到满足之后，担保银行才予以受理、付款的银行保函。