长期以来，市场上一直有“五星”和“飞天”两种商标的茅台酒同时销售，据茅台集团公司有关负责人介绍说，使用“五星”商标和使用“飞天”商标的茅台酒，酒质上没有任何差别。在包装车间，经常是将同一批次的酒统一勾兑好之后，上午包装“五星”，下午接着包装“飞天”，或者在同一时间，这个班组包装“五星”，下个班组包装“飞天”，因此两种商标的茅台酒只不过是包装各异而已。
茅台“五星”“飞天”对比
之所以有“五星”和“飞天”两种商标，是特定历史背景形成的。建国初期，地方国营的茅台酒厂成立后，初注册商标为“贵州茅台”，商标上端正中为工农携手图案，左右两边有波浪形线条，其下有“贵州茅苔酒”5个红色大字和“地方国营茅台酒厂出品”10个白色小字，1956年3月，“苔”字被恢复为“台”字。从1987年开始，茅台酒厂开始使用“中国贵州茅台酒厂出品”名称。
1953年，茅台酒开始向国外销售，商标图案也改由金色麦穗和红色五星组成。麦穗在外，五星居中，注册商标为“车轮”牌，即现在“五星”商标的前身，寓意茅台酒是新中国工农联盟的结晶。但在当时历史条件下，这一商标图案被国外一些反华势力视为“政治商标”，因而受到一些不应有的歧视。
为有利于外销，经原国家轻工部批准，茅台酒外销商标于1958年改为“飞天”商标，图案借用在西方社会影响很大的敦煌“飞天”形象，为两个飘飞云天的仙女捧一盏金杯，寓意茅台酒是外交友谊的使者。
三长
飞天茅台酒工艺中的"三长"主要指飞天茅台酒基酒生产周期长、大曲贮存时间长、飞天茅台酒基酒酒龄长。飞天茅台酒基酒生产周期长达一年，共分下沙、造沙二次投料，一至七个烤酒轮次，可概括为二次投料、九次蒸馏、八次发酵、七次取酒，历经春、夏、秋、冬一年时间。而其他名白酒只需几个月或十多天即可。
飞天茅台酒大曲贮存时间长达六个月才能流入制曲生产使用，比其他白酒多存3-4个月，这对提高飞天茅台酒基酒质量具有重要作用，而且大曲用量大，是其他白酒的4-5倍。
飞天茅台酒一般需要长达三年以上贮存才能勾兑，通过贮存可趋利避害，使酒体更醇香味美，加上飞天茅台酒高沸点物质丰富，更能体现飞天茅台酒的价值，这是其他香型白酒不具有的特点。
茅台酒工艺中的三高是指茅台酒生产工艺的高温制曲、高温堆积发酵、高温馏酒。茅台酒大曲在发酵过程中温度高达63℃，比其它任何名白酒的制曲发酵温度都高10－15℃；在整个大曲发酵过程中可优选环境微生物种类，后形成以耐高温产香的微生物体系，在制曲过程中首先做到了趋利避害之功效。高温堆积发酵是中国白酒生产敞开式发酵为经典和独创之作，也是其它名白酒工艺所不具有的。高温馏酒：蒸馏工艺本身是固液分离的技术，但茅台酒生产工艺的蒸馏与其它白酒完全不同。