恶意的程序：大家熟悉的恶意程序就是病毒，很多人认为病毒对数据的影响仅仅是病毒的破坏性，这是不正确的，实际上病毒的感染本身就是一种破坏，一个病毒无论他借助修改你的引导区、可执行程序还是OFFICE文档，他都把你正常的数据做了改变，当然，你可能举良性伴随性病毒这种极端的例子。但毫无疑问，他同样对数据构成了破坏，至少他减少了你的硬盘的可用空间。同时，恶意的程序还包括特洛伊木马，逻辑炸弹等等。恶意的程序造成的破坏可能是难恢复的。
其他恶意的破坏，即使不借助病毒或者其他的工具，只要拥有足够的权限，任何系统都有一定的“自毁”能力。比如依靠系统正常的删除、移动、格式化等操作也可以达到破坏数据的目的。随着网络技术的发展，威胁已经不仅于本机。
操作系统或应用软件的错误：随着操作系统和应用程序的代码量的成倍增加，BUG也在不断增加。我们常用的桌面系统WIN9X就是一个BUG大王。操作系统和应用软件的错误，往往会给人的工作带来一些不可预期的影响。比如前阶段，发现FRONTPAGE98的一个BUG，触发后会把你目录下的文件全部删除，另外，象的游戏神话II，出现了如不安装在默认目录中可能会使你丢失扩展分区这样严重的问题。
介绍国内的一些免费修复工具
FIXMBR：何公道先生写的一个修复MBR的工具，适合处理逻辑分区丢失的情况， 有一些可选参数，支持FAT32、FAT16，不支持NTFS、LINUX等分区，支持8.4G以上硬盘。可修复CIH发作后的扩展逻辑分区。
VRVFIX：北信源公司的推出的修复硬盘共享工具，适合处理逻辑分区丢失的情况，处理的基本比较准确。支持FAT32、FAT16，不支持NTFS、LINUX等分区。也不支持8.4G以上硬盘。
FIXC：国内早出现的可以修复部分被CIH破坏的C盘的工具，作者是NOZ，新版本也加入了修复分区信息的功能，支持FAT32、FAT16，有限支持NTFS，不支持8.4G以上硬盘。目前的版本已经比较完善。
FIXHDPT：TBSOFT工作室的分区信息修复工具。支持FAT32、FAT16，不支持NTFS和LINUX，不支持8.4G以上硬盘，是历史比较长的工具之一。
RE(ReapirEasy)：本人早期写的分区表修复工具，支持FAT32、FAT16，有限支持NTFS，不支持8.4G 以上硬盘，和某些BIOS不兼容。其整体水准低于前面列举的工具。国外一些系统维护的工具目前已经达到了非常强大的程度。
Norton Utilities：历史悠久的系统维护工具。不仅可以数据恢复，还可以系统加速和修补内存错误。目前的版本是NU4.5 FOR 9X、NU2 FOR NT等。
Tiramint：为出色的灾难恢复工具之一，有NTFS、FAT32、FAT16、NOVELL4种版本。生成急救软盘，可以对深度破坏的磁盘进行交叉恢复。